Suzume e Souta continuam tentando encontrar Daijin, o totem que escapou, causando a libertação das minhocas que atravessam as portas espalhadas pelo Japão. Após ser acolhida por uma moça gentil, Suzume se vê em mais uma enrascada quando seu caminho cruza o de Daijin. Retornando até a casa de Souta, os segredos dos antepassados dos guardiões e os meios necessários para vencer essa crise finalmente estarão ao alcance da garota… isso é, se ela estiver disposta a continuar.